Em 1988 é promulgada nova Constituição Federal, que dedica à área de ciência e tecnologia os artigos 218 e 219 do Capítulo IV – da Ciência e Tecnologia.
Em 15 de março de 1985, por meio do Decreto-Lei Nº 2.275, é criado o Ministério da Ciência e Tecnologia, ao qual a Finep passa a ficar vinculada.
Em 1984 é criado o PADCT, Programa de Apoio ao Desenvolvimento Científico e Tecnológico, com recursos do Banco Mundial e do governo brasileiro. O PADCT é voltado para apoiar o desenvolvimento científico e tecnológico em universidades e centros de pesquisas, operando por meio de comitês e de editais. A Finep foi o seu agente financeiro e o PADCT operou até 2000, quando foi extinto.
Presidentes da Finep
João Luiz Coutinho de Faria
Paulo de Campos Torres de Carvalho (vice)
(1988)
Fabio Celso de Macedo Soares Guimarães
Mário Brockman Machado (vice)
(1985)
Waldimir Pirró e Longo (vice)
(1984)
José Walter Merlo
Adeodato de Souza Neto (vice)
(1983)
Gerson Edson Ferreira Filho
José Adeodato de Souza Neto (vice)
(1980)
Ministros e Presidentes da República
Min. Ciência e Tecnologia
Decio de Zagottis (1989)
Ralph Biasi (1988/89)
MCT extinto (1988)
Luiz Henrique da Silveira (1987/88)
Renato Archer (1985/87)
Presidentes da República
José Sarney (1985/90)
João Batista Figueiredo (1979/85)